中國醫學科學院皮膚病研究所原稱中央皮膚性病研究所。1954年創建於北京，直屬衛生部領導。

　　郭沫若同志為該所題寫了所名。1958年歸屬中國醫學科學院領導，易為現名。該院所是國內最早成立的從事皮膚病、性病、麻風病基礎、臨床、防治研究的國家級專業機構。1970年從北京遷至江蘇泰州。1984年遷南京現址(紫金山麓玄武湖畔蔣王廟街14號)，並建立皮膚病醫院和全國性病防治研究中心。該院所佔地4.04萬平方米，建築面積2.63萬平方米。主要建築有門診樓、病房樓、醫技樓和科研樓、SPF級實驗動物房。兩個病區編制床位100張，設有20餘個臨床及科研科室以及現場防治研究基地。該所還是世界衛生組織性傳播疾病預防與控制合作中心、中國協和醫科大學博士生皮膚病教學基地、中國醫學真菌菌種保藏中心、衛生部皮膚病臨床藥理基地、國家藥品監督管理局皮膚病新藥臨床研究基地、中國-歐盟性病艾滋病防治培訓中心、中國協和醫科大學研究生院皮膚病與性病重點學科、教育部皮膚性病學重點學科、國家級繼續醫學教育基地；同時還承擔《中華皮膚科雜志》、《國外醫學皮膚性病學分冊》雜志的編輯任務。

　　現有職工315餘名，正副研究員、正副主任醫師60名，博士生導師9名，碩士生導師16名，享受政府特貼人員16名。47名專家在部、省級專業委員會任職；2名專家擔任世界衛生組織顧問；7名專家入選『333』跨世紀學術帶頭人培養計劃；2名專家入選『135』醫學重點人纔工程培養計劃。在承擔科研工作的同時還承擔著所在社區乃至全國范圍內的皮膚病醫療、防治和教學任務，為全國積極防治性病、基本消滅頭癬、麻風作出了貢獻。皮膚病性病治療水平國內領先：在皮膚科臨床診療和科研方面的綜合實力居國內領先地位，年門診量30餘萬人次，日接待患者達1000餘人次，設有20餘個科研及臨床研究科室，98年初開設了全國第一家性病示范門診，衛生部最早認定的HIV確診實驗室也在該院所。所兩個病區編制床位100張。開設普通門診、專家門診、特需門診、性病專科、激光美容中心、吸脂塑身中心、整形美容外科和中西醫結合門診以及血管瘤、甲癬、銀屑病、白癜風、真菌病、紅斑狼瘡、尋麻疹、禿發再生、痤瘡等專病門診。該院所對各種少見深部真菌病的治療、麻風病聯合化療和康復外科已達到國際水平。對性傳播疾病、大?病、特殊類型銀屑病、血管炎和某些皮膚腫瘤的診療、重癥藥疹的搶救、皮膚血管瘤的放射治療均處於國內領先水平。

　　在皮膚病性病學科領域，科研成果、論著佔有重要位置：1978年以來，該院所曾獲國家科技進步一等獎2項、二等獎2項、全國科學大會獎2項、部省級等科技成果80餘項，發表論文1500餘篇，被國家級雜志引用591篇，國際雜志引用47篇，其中SCI收錄30餘篇，該院所青年專家陳祥生同志獲2000年全國SCI收錄論文論文醫學類第一名(7篇)。出版皮膚科醫學專著48部(其中獲國家、衛生部優秀科技著作獎3項)；新藥證書10項、國內外專利5項。獲國家自然基金、省部級基金80項；性病、真菌病研究分別獲衛生部臨床重點學科建設項目；皮膚性病學專業被確定為教育部重點學科，同時該專業也被批准為江蘇省『135』醫學重點學科；醫學真菌菌種保藏錄入國際菌種資源信息網絡；對真菌、銀屑病、大?病、紅斑狼瘡診治、流行病學、組織病理等研究分別獲各級科技獎勵；該院所研制的雷公藤多?片已廣泛用於治療明顯炎癥及與免疫變態反應有關的疾病，其有效單體T4的研究已作為院校重大研究項目。性病診治，流行病學、疫情監測、耐藥監測等研究，獲國家自然科學基金、世行貸款資助達20多項。出版性病醫學專著11種。麻風病早期診療、畸殘矯治等研究獲國家級、部級和院校級科技成果獎31項。自行研制的USR、RPR國際通用梅毒診斷試劑盒被定為國家級新藥；主持研制的淋球菌培養基已通過專家鑒定，轉讓生產，供應全國。自行研制的皮膚病外用制劑近百種供門診使用，深受全國各地及外賓、港、澳、臺、僑胞的歡迎。利用學科優勢，於1999年建立護膚中心，開展對化妝品和護膚用品的檢測和實驗研究，目前已承接多項國內外護膚品檢測項目，獲得較好的社會效益和經濟效益。

　　教學與人纔培養：已培養博士研究生50名，碩士研究生49名；在讀研究生57名。為全國各地培訓皮膚病性病麻風病專業人員近萬名。承擔衛生部全國性病、麻風病防治任務：該所參與起草和制定國家性病、麻風病防治規劃、技術措施、標准和實施方案。負責衛生部性病和麻風病兩個專家諮詢委員會的日常工作。在全國大部分省、市、自治區設有性病、麻風病疫情監測點，負責全國各省、市、自治區性病、麻風病疫情報告，每年為全國各地性病防治機構培訓專業技術骨乾數百人，積極探索性病與艾滋病防治的結合點，努力將我國性病、艾滋病控制在最低范圍內；同時為實現在本世紀末我國基本消滅麻風病的目標而奮斗。1998年協助衛生部籌備了在北京召開的第15屆國際麻風大會，並在會議期間主辦了我國麻風病防治成就展覽，向全世界宣傳和介紹我國在麻風防治工作中取得的巨大成就。

　　廣泛開展國際學術交流與合作：該院所已與美、日、英、德等30多個國家和地區建立了技術交流與協作。有多名專家分別擔任世界麻風學會理事、世界衛生組織專家諮詢團委員、世界衛生組織性病專家諮詢委員會臨時顧問、世界微生物保藏中心委員會委員、亞洲皮膚科學會理事等職。 40餘年來，該所院廣大醫務工作者奉行嚴謹、博精、創新、奉獻的『協和精神』，形成了具有高度責任心、認真診療、精心護理的優良傳統，先後湧現出許多醫德醫風高尚、業務技術精湛的醫務工作者，搶救和挽回了無數重癥皮膚病患者的生命，享譽國內外。